Περιγραφή θέματος

  • Γενικά

    Βιοχημεία ΙΙ

    Διδάσκοντες: Καθ. Δ. Τσουκάτος, Αναπλ. Καθ. Α.-Ε. Κούκκου.

  • 1. Μεταβολισμός Αζωτούχων Ενώσεων

    Περιγραφή θεματικής ενότητας: Περιγράφονται αναλυτικά θέματα που αφορούν:

    • στην αναπλήρωση των πρωτεινών (διάμεσος μεταβολισμός,καταβολισμός πρωτεϊνών διατροφής, ο μηχανισμός πρόσδεσης της ουβικιτίνης στην πρωτεΐνη στόχο, το πρωτεόσωμα)
    • στον καταβολισμός των αμινοξέων (οι αμινομεταφοράσες, ο κύκλος της ουρίας, σύνδεση του κύκλου της ουρίας με τον κύκλο του κιτρικού, η τύχη του ανθρακικού σκελετού)
    • στη βιοσύνθεση των αμινοξέων (ο Κύκλος του Αζώτου,το σύμπλεγμα της Αζωτάσης, η ροή των ηλεκτρονίων, η μεταφορά της NH3 στα αμινοξέα, η βιοσύνθεση των αμινοξέων)
    • στην βιοσύνθεση των νουκλεοτιδίων (ονοματολογία βάσεων, νουκλεοζιτών, νουκλεοτιδίων, η De Novo βιοσύνθεση του πυριμιδινικού δακτυλίου,η βιοσύνθεση των Πουρινών,η Αναγωγάση των ριβονουκλεοτιδίων, ο μηχανισμός της αναγωγάσης,ο σχηματισμός του Θυμιδυλικού).

    Λέξεις κλειδιά: Πρωτείνες, Αμινοξέα, Πορφυρίνες Νουκλεοτίδια.

  • 2. ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ ΛΙΠΙΔΙΩΝ

    Περιγραφή θεματικής ενότητας: Γίνεται μελέτη θεμάτων που αφορούν στον μεταβολισμό των λιπίδιων. Αναλυτικότερα μελετώνται τα γλυκερολιπίδια ( L-διαμόρφωση), τα σφιγγολιπίδια και οι στερόλες.

    Λέξεις κλειδιά: Γλυκερολιπίδια, Λιπάσες, Φωσφολιπίδια, Φωσφολιπάσες, Σφιγγολιπίδια, HMG-Αναγωγάση, Στερόλες

  • 3. ΕΛΕΓΧΟΣ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΥ - ΒΙΟΣΗΜΑΤΟΔΟΤΗΣΗ

    Περιγραφή θεματικής ενότητας: Περιγράφονται θέματα που αφορούν στον έλεγχο του μεταβολισμού και της βιοσηματοδότησης (επικοινωνία με το περιβάλλον - βιοσηματοδότηση, σήματα – ορμόνες του μεταβολισμού, υποδοχείς ορμονών που ελέγχουν τον μεταβολισμό, διακοπή του σήματος, υποδοχείς στεροειδών ορμονών – βιοσηματοδότηση στον κυτταρικό πυρήνα)

    Λέξεις κλειδιά: Ορμόνες του μεταβολισμού, ορμονικοί υποδοχείς, δεύτεροι αγγελιοφόροι.

  • 4. ΣΥΝΘΕΣΗ DNA

    Περιγραφή θεματικής ενότητας:  Περιγράφεται η δομή των νουκλεϊνικών οξέων (προϊόντα υδρόλυσης των νουκλεϊνικών οξέων, πυριμιδίνες, πουρίνες, οι πεντόζες ριβόζη και δεόξυριβόζη, νουκλεοζίτες και νουκλεοτίδια). Μελετάται η πρωτοταγής δομή του DNA, η δευτεροταγής δομή του DNA ‐ η διπλή έλικα και η τριτοταγής δομή του DNA. Επίσης, αναλύεται η βιοσύνθεση του DNA ‐ αντιγραφή (πολυπλοκότητα και σημασία της βιοχημικής πορείας της αντιγραφής, αντιγραφή του DNA στα προκαρυωτικά κύτταρα, μοντέλα αντιγραφής, η βιοχημική πορεία της αντιγραφής, αντιγραφή του DNA στα ευκαρυωτικά κύτταρα).

    Λέξεις κλειδιά:  Δεοξυριβονουκλεϊκό οξύ (DNA), ριβονουκλεϊκό οξύ (RNA), νουκλεοτίδιο, αντιγραφή, μεταγραφή, εκκινητής, DNA πολυμεράση, RNA  πολυμεράση, τμήματα Okazaki, DNA λιγάση, εξόνιο, ιντρόνιο, μάτισμα.

  • 5. ΣΥΝΘΕΣΗ RNA

    Περιγραφή θεματικής ενότητας:  Μελετάται η βιοσύνθεση του RNA και η μεταγραφή. Αναλυτικότερα μελετώνται αναλυτικά η δομή και σύνθεση του RNA, τα μονόκλωνα μόρια RΝΑ που μπορούν να λάβουν δίκλωνες τριδιάστατες διαμορφώσεις, τα είδη RNA, η έννοια του αγγελιοφόρου RNA, η σύνθεση του RNA (μεταγραφή) συνοπτικά, οι πολλαπλές λειτουργίες της RNA πολυμεράσης, η χημεία της σύνθεσης RNA, η φυσαλίδα της μεταγραφής (το στάδιο της επιμήκυνσης), η μετα - μεταγραφική επεξεργασία προκαρυωτικών μορίων RNA, τα αντιβιοτικά - αναστολείς της προκαρυωτικής μεταγραφής.

    Λέξεις κλειδιά:  Μεταγραφή, RNA πολυμεράση, θέσεις προαγωγέων, φυσαλίδα μεταγραφής.

  • 6. ΣΥΝΘΕΣΗ ΠΡΩΤΕΪΝΩΝ

    Περιγραφή θεματικής ενότητας: Περιγράφεται η οργάνωση και η έκφραση της γενετικής πληροφορίας ‐ μετάφραση (βιοσύνθεση πρωτεϊνών). Ειδικότερα μελετώνται θέματα όπως ο γενετικός κώδικας, η ανακάλυψη του γενετικού κώδικα, τα χαρακτηριστικά του γενετικού κώδικα, ο εκφυλισμός του γενετικού κώδικα, η επεξεργασία (μάτισμα) ευκαρυωτικού RNA που δίδει ώριμο RNA (mRNA), η σύνθεση πρωτεϊνών: η μετάφραση νουκλεοτιδικών αλληλουχιών σε αλληλουχίες αμινοξέων, ο ρόλος του μεταφορικού RNA (tRNA) στην πρωτεϊνοσύνθεση, η σύνδεση των αμινοξέων με μόρια tRNA κ.α.)

    Λέξεις κλειδιά:  Μετάφραση, ριβόσωμα, μεταφορικό RNA (tRNA), κωδί-κιο, αντικωδίκιο, αλληλουχία Shine-Dalgarno. 

  • ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ

    Προτεινόμενα συγγράμματα
     
    • David L. Nelson, Michael M. Cox "Lehninger Βασικές αρχές Βιοχημείας» 4η Έκδοση  Ιατρικές Εκδόσεις Π.Χ. Πασχαλίδης
    • Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer "Βιοχημεια" 5η Έκδοση ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΑΚΕΣ ΕΚΔΟΣΕΙΣ ΚΡΗΤΗΣ